Razlika med genomiko in proteomiko

Genomika, proteomika in metabolomika o področja, ki odelujejo pri študiji in razvrščanju živih bitij pomočjo njihovih genomov, beljakovinki produkti, intetizirani na podlagi genetkih navodil, in vrta

Razlika med genomiko in proteomiko

Vsebina:

Glavna razlika - genomika proti proteomiki

Genomika, proteomika in metabolomika so področja, ki sodelujejo pri študiji in razvrščanju živih bitij s pomočjo njihovih genomov, beljakovinski produkti, sintetizirani na podlagi genetskih navodil, in vrsta molekul, ki jih presnavljajo. Genomika in proteomika sta tesno povezani področji. The glavna razlika med genomiko in proteomiko genomika je študija celotnega niza genov v genomu celice, medtem ko je proteomika študija celotnega niza beljakovin, ki jih proizvaja celica. Metabolomika pa je proučevanje celotnega niza nizkomolekularnih spojin, ki služijo kot substrati in stranski produkti encimskih reakcij celice.

Pokrita ključna območja

1. Kaj je Genomika
- Opredelitev, tehnike, klasifikacija
2. Kaj je proteomika
- Opredelitev, tehnike, klasifikacija
3. Kakšne so podobnosti med genomiko in proteomiko
- oris skupnih funkcij
4. Kakšna je razlika med genomiko in proteomiko
- Primerjava ključnih razlik

Ključni pojmi: geni, genomika, projekt človeškega genoma (HGP), projekt človeške proteome (HPP), beljakovine, proteomi, proteomika


Kaj je Genomika

Genomika se nanaša na preučevanje celotnega niza genov v genomu. Genom je popoln nabor genetskih informacij o organizmu, večinoma sestavljen iz DNK. Visoko prepustne tehnike se uporabljajo v genomiki za preslikavo, zaporedje in analizo genomov. Tehnike, ki sodelujejo pri genomiki, vključujejo strategije za sekvenciranje genov, kot je usmerjeno sekvenciranje genov, zaporedje streliva v celotnem genomu, konstrukcijo izraženih zaporednih oznak (ESTs), identifikacijo polimorfizmov posameznih nukleotidov (SNP) ter analizo in interpretacijo sekvenciranih podatkov z različno programsko opremo in podatkovnih baz. Glavni koraki zaporedja pušk so prikazani v slika 1.


Slika 1: Zaporedje streliva za okolje (ESS)
Vzorčenje, (B) Filtriranje delcev, (C) DNA ekstrakcija in liza, (D) kloniranje in knjižnica, (D) sekvenciranje, (E) sekvenčna montaža

Dve glavni področji genomike sta strukturna genomika in funkcionalna genomika. V strukturna genomikastrukturo in relativne položaje genov preučujemo v funkcionalna genomikaproučujejo funkcijo ali vlogo genov pri regulaciji presnovnih aktivnosti. Projekti zaporedja genoma so najnovejši razvoj v genomiki. Projekt človeškega genoma (HGP) je bil dokončan leta 2003. Cilji projekta Human Genome so bili:

  • Za identificirati vseh (približno 20.000-25.000) genov v človeškem genomu,
  • Določiti celotne sekvence (približno 3 milijarde kemičnih baznih parov), ki sestavljajo človeški genom,
  • Shraniti podatkov v podatkovnih bazah,
  • Izboljšati orodja za analizo podatkov,
  • Za prenos rtehnologije za zasebni sektor in. t
  • Nasloviti etičnih, pravnih in socialnih vprašanj (ELSI), ki lahko izhajajo iz projekta.

Poleg človeškega genoma so bili genomi miši in riža izpostavljeni tudi genomskim študijam.

Kaj je proteomika

Proteomika se nanaša na preučevanje celotnega niza beljakovin, ki jih proizvaja celica. Proteom je celoten sklop beljakovin, ki jih proizvaja celica. V proteomiki se karakterizacija 3D strukture in funkcija beljakovin izvaja z uporabo visoko propustnih metod. Tehnike, ki sodelujejo pri proteomiki, vključujejo ekstrakcijo in elektroforetsko ločevanje proteinov, razgradnjo proteinov z uporabo tripsina v majhne fragmente, določanje aminokislinskega zaporedja z masno spektrometrijo in identifikacijo proteinov z uporabo podatkov v podatkovnih bazah proteinov. Poleg tega lahko 3D strukturo proteina predvidimo z uporabo metod, ki temeljijo na programski opremi. Ekspresijo beljakovin lahko preučujemo z beljakovinskimi mikromrežami. Za določitev interakcij beljakovin in beljakovin je mogoče razviti karte beljakovinskih mrež. Prikazani so različni pojavi proteomike slika 2.


Slika 2: Proteomika

Proteinske produkte genov človeškega genoma preučujemo v okviru projekta človeške proteome (HPP). Eden glavnih ciljev projekta Human Proteome je identificirati beljakovine, ki so vključene v glavne bolezni.

Podobnosti med genomiko in proteomiko

  • Genomika in proteomika sta dve tesno povezani znanstveni področji, ki se uporabljata pri proučevanju organizmov.
  • Visoko prepustne tehnike se uporabljajo v genomiki in proteomiki.

Razlika med genomiko in proteomiko

Opredelitev

Genomika: Genomika se nanaša na preučevanje celotnega niza genov v genomu.

Proteomika: Proteomika se nanaša na preučevanje celotnega niza beljakovin, ki jih proizvaja celica.

Pojavi

Genomika: Genomika vključuje kartiranje, zaporedje in analizo genomov.

Proteomika: Proteomika vključuje 3D strukturo in funkcijo proteinov ter interakcije protein-protein.

Razvrstitev

Genomika: Dve vrsti genomike sta strukturna genomika in funkcionalna genomika.

Proteomika: Tri vrste proteomike so strukturna, funkcionalna in izrazna proteomika.

Pomembna območja

Genomika: Projekti sekvenciranja genoma, kot je projekt človeškega genoma, so pomembna področja genomike.

Proteomika: Razvoj podatkovne baze Proteome, kot sta SWISS-2DPAGE in razvoj programske opreme za računalniško podprto oblikovanje zdravil, so pomembna področja proteomike.

Zaključek

Genomika in proteomika sta dve znanstveni področji, ki se uporabljata pri proučevanju organizmov. Genomika je proučevanje celotnega niza genov v organizmu, medtem ko je proteomika študija celotnega niza beljakovin, ki jih proizvaja celica. Glavna razlika med genomiko in proteomiko je merilo vsakega področja med preučevanjem organizmov.

Sklic:

1. Griffiths, Anthony JF. »Genomika: pregled.« Uvod v genetsko analizo. 7. izdaja., U. S. National Library of Medicine, 1. januar 1970,