Razlika med ponavljajočo se DNA in satelitsko DNA - Razlika Med

Razlika med ponavljajočo se DNA in satelitsko DNA

Glavna razlika - ponavljajoča se DNA in satelitska DNA

Ponavljajoča se DNA in satelitska DNA sta dve vrsti DNA, ki jo najdemo v genomu večine evkariontov. The glavna razlika med ponavljajočo se DNA in satelitsko DNA ponavljajoča se DNK je majhna sekvenca DNA, ki se ponovi stotine ali tisočekrat, medtem ko je satelitska DNA zelo ponavljajoče se zaporedje DNK, ki predstavlja znaten del genoma.. Dve vrsti ponovitev, ki jih najdemo v genomu, sta tandemski ponovitvi in ​​vmesni ponovitvi. Satelitsko DNA sestavljajo številne tandemske ponovitve kratke osnovne ponavljajoče se enote. Leži na specifičnih kromosomih človeškega genoma in blizu centromerjev kromosomov.

Pokrita ključna območja

1. Kaj je ponavljajoča se DNA
- Definicija, maščobe, vrste
2. Kaj je satelitska DNA
- Definicija, dejstva, vrste
3. Kakšne so podobnosti med ponavljajočo se DNA in satelitsko DNA
- oris skupnih funkcij
4. Kakšna je razlika med ponavljajočo se DNA in satelitsko DNA
- Primerjava ključnih razlik

Ključni pojmi: razporejene ponovitve, mikrosateliti, minisateliti, ponavljajoča se DNA, satelitska DNA, tandemske ponovitve


Kaj je ponavljajoča se DNA

Ponavljajoča se DNA nanaša na dele DNA, ki se ponavljajo v celotnem genomu. Predstavlja neko količino nekodirane DNK, razširjene po celotnem euhromatinu. Ponavljajoča se enota lahko sestoji iz nekaj parov baz na stotine parov baz. Povprečna velikost ponavljajoče se enote je 300 bp. Lahko se ponovi za 10-105 kopij na genom. Dve glavni vrsti ponavljajoče se DNK sta ponavljajoči se tandemski ponovitvi. Tandemske ponovitve so prikazane v slika 1.


Slika 1: Ponovitve tandemov

V tandem ponavljajočih se kopijah ponavljajoče se zaporedne enote ležijo ena poleg druge, tvorijo blok ali matriko. Satelitska DNK je vrsta tandemskih ponovitev. Pri vmesnih ponovitvah se ponavljajoče sekvence razpršijo po celotnem genomu kot posamezne enote, ki so obdane z edinstveno sekvenco. Prenosljive elemente, kot so transpozoni DNA in retrotranspozoni, so ponovljeni.

Kaj je satelitska DNA

Satelitska DNA se nanaša na kratke, ponavljajoče se zaporedje DNA, ki se pogosto pojavljajo v centromernih regijah genoma. To je glavna funkcionalna enota centromere. Satelitsko DNA najdemo tudi v heterohromatinu kot glavni strukturni sestavini. V človeškem genomu lahko najdemo satelitsko DNK v kromosomih 1, 9 in 16 in kratke krake kromosomov 13-15, 21 in 22. Satelitska DNK je vrsta tandemskih ponovitev. Sestavljen je iz kratkih nukleotidnih sekvenc okoli 60 bp, ki se ponavljajo več kot 106 v genomu. Dve glavni vrsti satelitske DNA sta minisateliti in mikrosateliti. Minisatelitna sekvenca je prikazana v slika 2.


Slika 2: Minisatelitna DNA

Minisateliti so sestavljeni iz 10-60 parov baz v ponavljajoči se enoti. Nahajajo se na mnogih mestih v genomu, vključno s centromeri. Mikrosateliti so sestavljeni iz manj kot 10 baznih parov v ponavljajoči se enoti in se večinoma nahajajo v telomerah.

Podobnosti med ponavljajočo se DNA in satelitsko DNA

  • Ponavljajoča se DNA in satelitska DNA sta dve vrsti DNK, ki jo najdemo v evkariontskem genomu.
  • Tako ponavljajoča se DNA kot tudi satelitska DNA sestavljajo ponavljajoče se sekvenčne enote.
  • Tako ponavljajoča se DNA kot tudi satelitska DNA sta vrsti nekodirajoče DNA.
  • Tako ponavljajoča se DNA kot tudi satelitska DNA ne kodirata beljakovin.
  • Tako ponavljajoča se DNA in satelitska DNA se nahajata v medgenih območjih.
  • Tako ponavljajoča se DNA kot tudi satelitska DNA sta pomembna pri ohranjanju strukture genoma.

Razlika med ponavljajočo se DNA in satelitsko DNA

Opredelitev

Ponavljajoča se DNA: Ponavljajoča se DNA nanaša na dele DNA, ki se ponavljajo v celotnem genomu.

Satelitska DNK: Satelitska DNA se nanaša na kratka ponavljajoča se zaporedja DNA, ki se pogosto nahaja v centromernih regijah genoma.

Vrste ponavljajočih se zaporedij

Ponavljajoča se DNA: Ponavljajoča se DNK sestoji bodisi iz tandemskih ponovitev bodisi iz vmesnih ponovitev.

Satelitska DNK: Satelitska DNA je sestavljena iz tandemskih ponovitev.

Velikost ponavljajoče se enote

Ponavljajoča se DNA: Ponavljajoča se DNA lahko sestavlja nekaj parov baz v stotine parov baz v ponavljajoči se enoti.

Satelitska DNK: Satelitsko DNA sestavljajo kratke ponavljajoče se enote (do 60 baznih parov).

Stopnja ponavljanja

Ponavljajoča se DNA: Ponavljajoča se DNK je zmerno ponavljajoče se zaporedje (10-105 ponavlja na genom).

Satelitska DNK: Satelitska DNA je sestavljena iz zelo ponavljajočih se zaporedij (> 10)6 ponavlja na genom).

Nahaja se v

Ponavljajoča se DNA: Ponavljajoča se DNA nahaja v intergenskih predelih genoma.

Satelitska DNK: Satelitska DNK se nahaja na specifičnih kromosomih in centromerih kromosomov.

Vrste

Ponavljajoča se DNA: Dve glavni vrsti ponavljajoče se DNK sta ponavljajoči se tandemski ponovitvi.

Satelitska DNK: Dve glavni vrsti satelitske DNK sta mikrosatelitov in minisetelitov.

Vloga

Ponavljajoča se DNA: Ponavljajoča se DNK služi kot evolucijska naprava, ki katalizira nastanek novih genov.

Satelitska DNK: Satelitska DNK ima pomembno vlogo pri odvzemu DNA.

V analizi gostote CsCl

Ponavljajoča se DNA: Ponavljajoča se DNA pojavi kot svetlobni pasovi.

Satelitska DNK: Satelitska DNK se pojavi kot majhni temni pasovi.

Zaključek

Ponavljajoča se DNA in satelitska DNA sta dve vrsti ponovitev DNK, ki jih najdemo v genomu. Ponavljajoča se DNK je zmerno ponavljajoča se zaporedja DNA, medtem ko so satelitske DNA zelo ponavljajoče se kratke sekvence DNA. Glavna razlika med ponavljajočo in satelitsko DNA je stopnja ponavljanja.

Sklic:

1. López-Flores, I., in M. A. Garrido-Ramos. »Ponavljajoča se vsebnost DNK evkariontskih genomov.« Karger Publishers, 25. junij 2012,