Razlika med izbirnim označevalcem in poročevalskim genom - Razlika Med

Razlika med izbirnim označevalcem in poročevalskim genom

The glavna razlika med selektivnim markerjem in reporterskim genom je, da izbirni marker se uporablja za razlikovanje med transformanti in ne-transformanti, medtem ko se reporterski gen uporablja za merjenje stopnje ekspresije transformiranega gena. Poleg tega ima selektiven markerski gen svoj lastni promotor, medtem ko je ekspresija reporterskega gena regulirana s promotorjem transformiranega gena.

Izbirni izdelovalec in reporterski gen sta dve vrsti genov, ki se uporabljata za analizo transformantov v študijah, ki proizvajajo transgene organizme.

Pokrita ključna območja

1. Kaj je označevalec, ki ga je mogoče izbrati
     – Definicija, namen, primeri
2. Kaj je reporterski gen
     – Definicija, namen, primeri
3. Kakšne so podobnosti med izbirnim označevalcem in poročevalskim genom
     – Oris skupnih funkcij
4. Kakšna je razlika med izbirnim označevalcem in poročevalskim genom
     – Primerjava ključnih razlik

Ključni pogoji

Analiza ekspresije genov, zanimivi gen, reporterski gen, izbirni marker, transformanti


Kaj je izbirni označevalnik

Izbirni marker je vrsta markerskih genov, ki se na splošno nahajajo v plazmidu. Pretvori se v celico gostitelja s pomočjo plazmida. Transformanti, ki vsebujejo selektiven marker, lahko rastejo v ustreznem izbirnem mediju. Toda ne-transformanti, ki nimajo izbirnega markerja, ne morejo rasti v tem izbirnem mediju. To pomeni, da genski produkt selektivnega markerja postane izbirni faktor za preživetje.

Tri skupine selektivnih markerjev so geni za odpornost na antibiotike, geni za antimetabolne markerje in geni za odpornost na herbicide. Najpogosteje uporabljeni izbirni markerji so geni za odpornost na antibiotike. Zato lahko v mediju rastejo samo transformanti, ki vsebujejo ustrezen antibiotik.

Izbirni marker



Slika 1: Vloga genov, odpornih proti antibiotikom, pri molekularnem kloniranju

Vendar pa vsi transformanti ne smejo vsebovati zadevnega gena. Nekateri transformanti lahko imajo samo vektor s selektivnim markerjem. Analiza sekvenciranja ali genske ekspresije dovoljuje le detekcijo rekombinantov, ki imajo zanimiv gen.

Kaj je reporterski gen

Reporter gen je vrsta markerskih genov, ki se uporabljajo za kvantificiranje genske ekspresije. Spajajo se z regulacijskim zaporedjem gena, ki nas zanima. Razen analize izražanja zanimivega gena, reporterski geni omogočajo proučevanje funkcije regulacijskih elementov gena in učinka transkripcijskih faktorjev na gensko ekspresijo. Tudi reporterski geni so ključnega pomena pri identifikaciji specifičnega tkiva ali specifične genske ekspresije.


Slika 2: Vloga poročevalskega gena

Zeleni fluorescentni protein (GFP) in luciferaza sta najpogostejša vrsta reporterskih genov. GFP je žareča beljakovina pod UV svetlobo. Prisotnost drugih fluorescenčnih proteinov, kot so rdeči in rumeni fluorescentni proteini, omogočajo identifikacijo različnih beljakovin v istem sistemu. Luciferaza je encim, ki katalizira nastajanje rumeno-zelene ali modre svetlobe iz substrata luciferina.

Podobnosti med izbirnim označevalcem in poročevalskim genom

  • Izbirni marker in reporter gen sta dve vrsti markerskih genov, ki se uporabljajo za analizo transformantov.
  • Transformirajo se v organizem gostitelja skupaj z zanimivim genom.
  • Oba tipa reporterskih genov nista prisotna v gostiteljski celici v normalnih pogojih. Zato so gostiteljske celice tuje.

Razlika med izbirnim označevalcem in poročilom Gene

Opredelitev

Izbirni marker se nanaša na gen, katerega ekspresija omogoča identifikacijo celic, ki so bile transformirane ali transfektirane z vektorjem, ki vsebuje markerski gen, medtem ko se reporterski gen nanaša na gen, ki se uporablja za "označevanje" drugega gena ali zaporedja DNA, ki je zanimiva, kot je promotor.

Pomen

Izbirni marker pomaga razlikovati med transformanti in ne-transformanti, medtem ko reporterski gen pomaga meriti količino ekspresije transformiranega gena.

Promotor

Izbirni marker ima svoj lastni promotor, medtem ko se reporterski gen regulira pod promotorjem transformiranega gena.

Lokacija

Izbirni izdelovalec je lahko v plazmidu ali znotraj genskega konstrukta, medtem ko je reporterski gen med promotorjem in zanimivim genom.

Rezultat

Transformirane celice z izbirnim izdelovalcem lahko rastejo v izbirnem mediju, toda ne-transformant ne more rasti, ker jim manjka selektivni marker, medtem ko je količina genskega produkta v reporterskem genu odvisna od količine uspešno transformiranih genov, ki nas zanimajo.

Primeri

Geni za odpornost na antibiotike, geni za antimetabolne markerje in geni za odpornost na herbicide so vrste selektivnih markerjev, medtem ko sta GFP in Luciferaza nekateri reporterski geni.

Zaključek

Izbrane markerje so markerski geni, ki se uporabljajo za prikaz transformantov v ustreznem izbirnem mediju, medtem ko so reporterski geni markerski geni za merjenje količine ekspresije. Glavna razlika med izbirnimi markerji in reporterskimi geni je vrsta presejanja.

Sklic:

1. Jha, Nandkishor. »Izbirni geni za označevanje in geni poročevalcev«. Razprava o biologiji, 16. oktober 2015,