Razlika med VNTR in STR - Razlika Med

Razlika med VNTR in STR

Glavna razlika - VNTR vs STR

Ponavljajoča se DNK je vzorec nukleinskih kislin, ki se pojavljajo v več kopijah po vsem genomu. V eukariotih tvorijo velike deleže jedrne DNA. Tandemske ponovitve so eden glavnih tipov ponavljajoče se DNA, ki kopirajo enote ponavljajoče se sekvence, ki ležijo ena poleg druge in tvorijo nukleotidni blok. VNTR (spremenljivo število tandemskih ponovitev) in STR (kratke tandemske ponovitve) sta dve vrsti tandemskih ponovitev, ki jih najdemo v evkariontskem genomu. VNTR je vrsta minisatelitne DNA, medtem ko je STR vrsta mikrosatelitne DNA. The glavna razlika med VNTR in STR je to ponavljajoča se enota VNTR je 10-60 baznih parov, medtem ko je ponavljajoča se enota STR 2-6 baznih parov.

Pokrita ključna območja

1. Kaj je VNTR
- Definicija, značilnosti, pomen
2. Kaj je STR
- Definicija, značilnosti, pomen
3. Kakšne so podobnosti med VNTR in STR
- oris skupnih funkcij
4. Kakšna je razlika med VNTR in STR
- Primerjava ključnih razlik

Ključne besede: forenzična genetika, mikrosatelit, minisatelit, ponavljajoče se nukleotidne enote, STR, tandemske ponovitve, VNTR


Kaj je VNTR

VNTR se nanaša na vrsto tandemskih ponovitev, pri katerih se kratko zaporedje nukleotidov (10-60 parov baz) ponovi različno številokrat na določenem mestu. Zato je VNTR znan tudi kot minisateliti. VNTR-ji so razporejeni po kromosomih evkariontskega genoma. Na splošno se število ponovljenih enot v VNTR razlikuje med posamezniki. Zato se dolžina polja, ki ga tvorijo VNTR, razlikuje tudi med posamezniki. Ker je število kromosomov podedovano od staršev, se lahko uporabijo pri starševski ali osebni identifikaciji. Spremembe VNTR v šestih posameznikih so prikazane v slika 1.


Slika 1: Variacije VNTR pri posameznikih

VNTR so prvi tipi polimorfizmov, ki se uporabljajo pri profiliranju DNK za določanje značilnosti DNA določene osebe. Uporabljajo se tudi kot genetski označevalci v RFLP (restrikcijski fragmentni dolžinski polimorfizem), tehnika, ki uporablja PCR, gelno elektroforezo in produkcijo pasnih vzorcev po južnem blotingu.

Kaj je STR

STR se nanaša na vrsto tandemskih ponovitev, pri katerih se kratko zaporedje nukleotidov (2-6 parov baz) ponovi različno številokrat na določenem mestu. STRs so vrsta mikrosatelitov in so znani tudi kot ponovitve kratkega zaporedja (SSR) v genetiki rastlin. Ponavljajoče se enote, sestavljene iz enega nukleotida, so znane kot polimorfizem posameznega nukleotida (SNP). STRs so najpogostejši tip genetskih polimorfizmov, ki jih trenutno analiziramo v forenzični genetiki. Profiliranje DNK z uporabo STRs kot genetskih označevalcev je prikazano v slika 2.


Slika 2: Profiliranje DNA

Mutacije v nekaterih regijah STR vodijo do genetskih bolezni, kot so krhki sindrom X in Huntingtonova bolezen.

Podobnosti med VNTR in STR

  • VNTR in STR sta dve vrsti tandemskih ponovitev.
  • Oba VNTR in STR sta strukturni regiji evkariontskega genoma.
  • Oba VNTR in STR sta sestavljena iz nekodirajoče DNA.
  • Oba VNTR in STR sta podedovana od staršev.
  • Oba VNTR in STR sta sestavljena iz ponavljajočih se zaporedij, ki razporejajo sosednje v nizu.
  • Oba VNTR in STR proizvajajo genetski polimorfizem.
  • Oba VNTR in STR sta razširjena po celotnem genomu.
  • Oba VNTR in STR se uporabljata kot genetski označevalci v forenzični genetiki.
  • Mutacije v VNTR in STR povzročajo genetske bolezni.

Razlika med VNTR in STR

Opredelitev

VNTR: VNTR je vrsta tandemske ponovitve, pri kateri se kratko zaporedje nukleotidov (10-60 parov baz) ponovi različno številokrat na določenem mestu.

STR: STR je vrsta tandemskega ponavljanja, pri katerem se kratko zaporedje nukleotidov (2-6 parov baz) ponovi različno številokrat na določenem mestu.

Število ponavljajočih se nukleotidov

VNTR: VNTR je sestavljen iz 10-60 baznih parov.

STR: STR je sestavljen iz 2-6 baznih parov.

Vrsta ponavljajoče se DNA

VNTR: VNTR je vrsta minisatelitne DNA.

STR: STR je vrsta mikrosatelitne DNA.

Število ponovitev

VNTR: VNTR je sestavljen iz 10-1.500 ponovitev v matriki.

STR: STR se sestoji iz 5-200 ponovitev v matriki.

Velikost polja

VNTR: VNTR oblikuje niz 0,5-15 kb.

STR: STR oblikuje niz 10-1000 bp.

Kompleksnost matrike

VNTR: VNTR proizvaja heterogene matrike.

STR: STR proizvaja homogene matrike.

Zaključek

VNTR in STR sta dve vrsti tandemskih ponovitev, ki tvorita nizove sosednjih ponavljajočih se enot v evkariontskem genomu. VNTR je sestavljen iz relativno dolgih ponavljajočih se enot nukleotidov (10-60 baznih parov). STR sestavljajo kratke ponavljajoče se enote nukleotidov (2-6 bp). Glavna razlika med VNTR in STR je dolžina ponavljajočih se enot vsake vrste tandemskih ponovitev.

Sklic:

1. “Tandemsko ponavljanje s spremenljivo številko” ScienceDirect Topics,