Kako so imenovani encimi - Razlika Med

Kako so imenovani encimi

Encim je beljakovinska molekula, ki lahko deluje kot biološki katalizator. Encimi imajo tri značilne lastnosti. Prvič, glavna funkcija encima je povečati hitrost reakcije. Drugič, en določen encim deluje specifično na določen substrat in proizvaja izdelek. In tretjič, encime lahko reguliramo z nizko aktivnostjo do visoke aktivnosti in obratno. Nekateri encimi so sposobni katalizirati isto reakcijo. Imenujejo se izozimi. Za sintetizacijo je genetsko programirana edinstvena zbirka približno 3 000 encimov, ki celici zagotavljajo individualnost. Če en encim postane napačen, bi bil učinek katastrofalen. Običajna imena in sistematična imena se uporabljajo pri poimenovanju encimov.

Ta članek pojasnjuje,

1. Kako so imenovani encimi
2. Poimenovanje načel encimov
3. Ravni razvrstitve encimov

Kako so imenovani encimi

Splošna imena encimov navadno vsebujejo predpono, ki opisuje ime učinka encimov substrata ali kemijsko reakcijo, ki jo katalizirajo. Predponi sledi pripona „ase“. Ta pripona preprosto označuje identifikacijo, da je spojina encim. Na primer, encim, ki razgradi beljakovine v aminokisline, se imenuje "proteinaza" ali "proteaza". Enako je encim, ki sodeluje pri dehidraciji alkoholov, imenovan "alkoholna dehidrogenaza". Pri poimenovanju nekaterih prvotno preučenih encimov, kot so renin, pepsin in tripsin, se uporabljajo starejša trivialna imena. Encim glukozidaza je prikazan v slika 1. Katalizira pretvorbo maltoze v dve molekuli glukoze.


Slika 1: Glukozidazni encim

Sistematično nomenklaturo in razvrstitev encimov po reakciji, ki jo katalizirata, je razvila Mednarodna zveza za biokemijo in molekularno biologijo (IUBMB). Nomenklatura in klasifikacija encimov se ukvarjata skupaj zaradi njihove tesne medsebojne odvisnosti.

Načela imenovanja encimov

Tri splošna načela v nomenklaturi encimov so: t

1. Pripona -ase uporabiti samo za posamezne katalizatorje. Zato ga ni mogoče uporabiti za sisteme, ki vsebujejo več kot en encim.
2. Razvrstitev po načelih in nomenklatura morata temeljiti na reakciji, ki jo katalizira določen encim.
3. Encimi so razdeljeni v skupine, odvisno od kataliziranih reakcij.

Funkcionalno povezane skupine encimov so razvrščene z dodelitvijo kodnih številk vsaki skupini. Številke oznak imajo predznak „ES“ skupaj s štirimi elementi, ki so ločeni s točkami. Štirje elementi vsebujejo naslednje pomene:

  1. Prva številka označuje razred encima.
  2. Druga številka označuje podrazred encima.
  3. Četrta številka označuje podskupino encima.
  4. V peti sliki je navedena serijska številka encima v podklasu.

Razvrstitev encimov

Najvišja stopnja razvrstitve encimov, njihova imena in funkcije so prikazane v spodnji tabeli.

Razredi encimov

Ime in funkcija

ES 1

Oksidoreduktaze: Dodajanje ali odstranjevanje vode

ES 2

Transferaze: Prenos elektronov

ES 3

Hidrolize: Prenos radikala

ES 4

Lijaze: Delitev ali oblikovanje C-C vezi

ES 5

Izomeraze: Spreminjanje geometrije ali strukture molekule

ES 6

Ligaze: Združitev dveh molekul s hidrolizo fosfatne vezi v ATP ali drugem trifosfatu.

Tabela 1: Najvišja stopnja razvrstitve encimov

Ta nomenklatura lahko v celoti določi encim. Na primer, heksokinaza je transferaza (EC 2), dodajanje fosfatne skupine (EC 2,7) v heksozne sladkorje, ki vsebujejo alkoholno skupino (ES 2.7.1). Zato je nomenklatura heksokinaze EC 2.7.1.1.

Zaključek

Encimi povečujejo hitrost reakcij s kataliziranjem. Pogosto se imenujejo na podlagi substrata, na katerega delujejo. Enzimi se imenujejo tudi glede na vrsto reakcije, ki jo katalizirajo. IUBMB je razvil sistematično nomenklaturo, ki združuje z encimsko klasifikacijo. Encimi so se razvili v šest razredov po sistematični nomenklaturi encimov.

Sklic:
1. „Encimska nomenklatura“. IUBMB biokemična nomenklatura. N.p., n.d. Splet. 20. maj 2017.